19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4296 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  45.49 
 
 
259 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  32.68 
 
 
239 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  33.48 
 
 
246 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  32.78 
 
 
246 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  30.8 
 
 
243 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  31.27 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  30.38 
 
 
241 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  28.29 
 
 
240 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  28.29 
 
 
240 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  29.11 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  30.59 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  28.34 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  36.7 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  24.89 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  28.42 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0067  hypothetical protein  24.53 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>