20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5911 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5911  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.976482  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6179  hypothetical protein  96.36 
 
 		 330 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7394  hypothetical protein  86.73 
 
 		 314 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1358  putative glycosyltransferase  69.02 
 
 		 314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3266  hypothetical protein  69.44 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3254  putative glycosyl transferase  69.44 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3215  putative glycosyl transferase  69.23 
 
 		 314 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3270  hypothetical protein  56.7 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1206  hypothetical protein  31.84 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.0226613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3248  putative glycosyltransferase  32.96 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.742684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2601  putative glycosyltransferase  32.46 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  21.25 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.37 
 
 		 484 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 397 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>