15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2601 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2601  putative glycosyltransferase  100 
 
 
290 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3248  putative glycosyltransferase  99.31 
 
 
290 aa  583  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1206  hypothetical protein  57.48 
 
 
306 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.0226613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  29.67 
 
 
305 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1358  putative glycosyltransferase  33.86 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3266  hypothetical protein  34.92 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3215  putative glycosyl transferase  34.92 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3254  putative glycosyl transferase  34.92 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3270  hypothetical protein  32.3 
 
 
328 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7394  hypothetical protein  32.02 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6179  hypothetical protein  30.51 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5911  hypothetical protein  32.09 
 
 
330 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.976482  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  37.38 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
374 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  32.48 
 
 
373 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>