60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3960 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3453  hypothetical protein  98.73 
 
 		 316 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2012  hypothetical protein  92.72 
 
 		 316 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279391  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4306  hypothetical protein  94.3 
 
 		 316 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4060  hypothetical protein  94.3 
 
 		 316 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3465  hypothetical protein  93.99 
 
 		 316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4531  hypothetical protein  91.46 
 
 		 316 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0932  putative integral membrane protein  81.01 
 
 		 317 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0091  hypothetical protein  53.33 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0066  hypothetical protein  50.79 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1970  protein of unknown function DUF979  53.33 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1377  hypothetical protein  50.31 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0657  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2370  protein of unknown function DUF979  53.02 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0320038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2167  hypothetical protein  51.25 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0578  hypothetical protein  50 
 
 		 317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2880  protein of unknown function DUF979  51.58 
 
 		 317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0226  hypothetical protein  52.68 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5730  hypothetical protein  50.47 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290991  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0872  hypothetical protein  48.75 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0814549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3084  hypothetical protein  48.6 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2481  hypothetical protein  54.75 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2115  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3372  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2976  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3307  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0444  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0249  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0262  hypothetical protein  52.55 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2569  protein of unknown function DUF979  50.64 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1218  hypothetical protein  50 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2907  hypothetical protein  52.72 
 
 		 318 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3290  protein of unknown function DUF979  46.83 
 
 		 329 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0191  hypothetical protein  53.87 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0006  hypothetical protein  48.61 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.686055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3098  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2845  permease  49.22 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3116  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00155748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3093  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2878  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0377318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3117  hypothetical protein  49.22 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2152  hypothetical protein  48.91 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2057  hypothetical protein  48.6 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0956308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2806  permease  48.91 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2870  hypothetical protein  47.98 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3593  hypothetical protein  45.24 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1171  hypothetical protein  45.24 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1119  hypothetical protein  45.24 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0174836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3745  protein of unknown function DUF979  54.45 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.412774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1259  hypothetical protein  46.73 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  normal  0.819314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0438  protein of unknown function DUF979  48.72 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0019  putative transmembrane protein  47.09 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1183  protein of unknown function DUF979  45.43 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6524  protein of unknown function DUF979  40.84 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1373  hypothetical protein  39.51 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1679  hypothetical protein  39.23 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.559939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1414  hypothetical protein  38.91 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.488248  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1833  hypothetical protein  37.99 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.407427 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0176  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1236  protein of unknown function DUF979  36.94 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>