60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0066 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0091  hypothetical protein  88.92 
 
 		 316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2167  hypothetical protein  81.96 
 
 		 318 aa  527  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1970  protein of unknown function DUF979  83.54 
 
 		 318 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2370  protein of unknown function DUF979  83.86 
 
 		 318 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0320038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0872  hypothetical protein  68.99 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0814549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5730  hypothetical protein  68.67 
 
 		 317 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290991  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0226  hypothetical protein  65.19 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3372  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2907  hypothetical protein  66.46 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0262  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0249  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2115  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2976  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3307  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0444  hypothetical protein  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0191  hypothetical protein  66.77 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0006  hypothetical protein  65.19 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.686055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3745  protein of unknown function DUF979  67.41 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.412774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3593  hypothetical protein  57.27 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1119  hypothetical protein  57.27 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0174836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1171  hypothetical protein  57.27 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1218  hypothetical protein  54.32 
 
 		 331 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1259  hypothetical protein  54.3 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  normal  0.819314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2880  protein of unknown function DUF979  53.53 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2569  protein of unknown function DUF979  53.67 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3290  protein of unknown function DUF979  52.32 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3084  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2012  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279391  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6524  protein of unknown function DUF979  49.04 
 
 		 316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2057  hypothetical protein  45.51 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0956308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3098  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2806  permease  46.79 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1183  protein of unknown function DUF979  50 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3117  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  299  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2845  permease  46.79 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3116  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00155748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2870  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3093  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2878  hypothetical protein  46.79 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0377318  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4060  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4306  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0019  putative transmembrane protein  49.07 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2152  hypothetical protein  46.47 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3465  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0932  putative integral membrane protein  48.42 
 
 		 317 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4531  hypothetical protein  49.21 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3960  hypothetical protein  49.21 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.558288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1377  hypothetical protein  45.6 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0578  hypothetical protein  45.28 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0657  hypothetical protein  45.28 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3453  hypothetical protein  48.57 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0438  protein of unknown function DUF979  45.08 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2481  hypothetical protein  47.63 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1833  hypothetical protein  41.88 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.407427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1373  hypothetical protein  40.81 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1414  hypothetical protein  37.06 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.488248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1679  hypothetical protein  36.74 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.559939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0176  hypothetical protein  37.74 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1236  protein of unknown function DUF979  34.84 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>