37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2556 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2683  hypothetical protein  93.66 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2665  hypothetical protein  86.08 
 
 		 195 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2636  hypothetical protein  86.08 
 
 		 195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2025  hypothetical protein  86.08 
 
 		 195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5967  hypothetical protein  88.27 
 
 		 195 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0662  hypothetical protein  82.99 
 
 		 198 aa  328  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0288  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2416  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0583  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0825  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0029  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0034848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0986  hypothetical protein  68.23 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0829  hypothetical protein  67.71 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0451  hypothetical protein  64.13 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0472257  normal  0.862422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0655  hypothetical protein  67.01 
 
 		 205 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0681  hypothetical protein  61.5 
 
 		 191 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3285  hypothetical protein  59.16 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0470  hypothetical protein  50.76 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0488  hypothetical protein  45.6 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0542  hypothetical protein  47.89 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0483  hypothetical protein  50.51 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0562  hypothetical protein  49.22 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4835  hypothetical protein  47.89 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1822  hypothetical protein  38.92 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4984  hypothetical protein  53.38 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0335  hypothetical protein  43.08 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0262  hypothetical protein  41.84 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0314  hypothetical protein  45.99 
 
 		 179 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0319  hypothetical protein  45.99 
 
 		 179 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0427  hypothetical protein  42.5 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3543  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0100  hypothetical protein  41.45 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0384  hypothetical protein  41.75 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1306  hypothetical protein  40.84 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2466  hypothetical protein  40.21 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0876741  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2572  hypothetical protein  39.36 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00804347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>