37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0488 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0542  hypothetical protein  71.12 
 
 		 191 aa  290  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0470  hypothetical protein  58.85 
 
 		 193 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0562  hypothetical protein  60.62 
 
 		 195 aa  235  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0483  hypothetical protein  58.85 
 
 		 193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0451  hypothetical protein  50.79 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0472257  normal  0.862422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1822  hypothetical protein  45.59 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3285  hypothetical protein  48.26 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0288  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0029  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0034848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0825  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2416  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0583  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0986  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0829  hypothetical protein  46.73 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0681  hypothetical protein  48.47 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0655  hypothetical protein  46 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0662  hypothetical protein  48.21 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2665  hypothetical protein  47.42 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2025  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2636  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2556  hypothetical protein  45.6 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2683  hypothetical protein  44.79 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5967  hypothetical protein  44.85 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4835  hypothetical protein  40.1 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4984  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0262  hypothetical protein  37.56 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0314  hypothetical protein  40.51 
 
 		 179 aa  124  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0319  hypothetical protein  40.51 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0384  hypothetical protein  39.11 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0100  hypothetical protein  35.86 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0335  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0427  hypothetical protein  36.71 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2466  hypothetical protein  34.74 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0876741  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1306  hypothetical protein  35.86 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3543  hypothetical protein  34.69 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2572  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00804347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>