37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0562 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0562  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0470  hypothetical protein  73.44 
 
 		 193 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0483  hypothetical protein  72.92 
 
 		 193 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0488  hypothetical protein  60.62 
 
 		 190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0542  hypothetical protein  61.78 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1822  hypothetical protein  46.08 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0681  hypothetical protein  51.79 
 
 		 191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0655  hypothetical protein  50.5 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0288  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0029  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0034848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0825  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2416  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0583  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.287493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0986  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0829  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0451  hypothetical protein  48.69 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0472257  normal  0.862422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2025  hypothetical protein  49.74 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2636  hypothetical protein  49.74 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3285  hypothetical protein  47.24 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2665  hypothetical protein  49.22 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2683  hypothetical protein  49.49 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0662  hypothetical protein  48.7 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2556  hypothetical protein  49.22 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5967  hypothetical protein  47.45 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4835  hypothetical protein  40.4 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4984  hypothetical protein  48.92 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0427  hypothetical protein  40.39 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0335  hypothetical protein  40.38 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0262  hypothetical protein  40.1 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0319  hypothetical protein  47.1 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0314  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0100  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3543  hypothetical protein  44.88 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2466  hypothetical protein  36.45 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0876741  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1306  hypothetical protein  45.31 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2572  hypothetical protein  49.06 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00804347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>