10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0022 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0025  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  98.39 
 
 
990 bp  1047    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0022    100 
 
 
947 bp  1877    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1574  inner-membrane translocator  87.39 
 
 
942 bp  117  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  88.24 
 
 
948 bp  71.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1838  inner-membrane translocator  89.29 
 
 
954 bp  63.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.116959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  94.29 
 
 
954 bp  54  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1680  inner-membrane translocator  100 
 
 
954 bp  52  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2024  inner-membrane translocator  100 
 
 
954 bp  52  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.266794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  83.56 
 
 
948 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2818  inner-membrane translocator  82.5 
 
 
939 bp  48.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.133743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>