11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0020 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1381  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.443541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>