93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1513 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1513  ribonucleoside-diphosphate reductase, subunit beta  100 
 
 
133 aa  268  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1244  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1444  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1471  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1242  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.469599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1372  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.47 
 
 
322 aa  266  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3937  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  96.95 
 
 
322 aa  262  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.216527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1406  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  96.18 
 
 
322 aa  261  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.357607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.66 
 
 
322 aa  258  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1076  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.08 
 
 
322 aa  247  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3416  hypothetical protein  56.82 
 
 
323 aa  157  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0962028  normal  0.690578 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3232  hypothetical protein  56.82 
 
 
323 aa  157  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259813  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2764  Ribonucleoside-diphosphate reductase  56.59 
 
 
331 aa  154  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0398  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  59.38 
 
 
322 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0773  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  57.81 
 
 
323 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.443728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0756  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  57.81 
 
 
323 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0968  ribonucleoside-diphosphate reductase  53.44 
 
 
429 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  53.08 
 
 
340 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0531925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0542  Ribonucleoside-diphosphate reductase  52.76 
 
 
333 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0256  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.39 
 
 
325 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0141  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  46.51 
 
 
337 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1249  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  47.29 
 
 
320 aa  124  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0818  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  46.51 
 
 
319 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1775  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  48 
 
 
319 aa  120  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0127237  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0380  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  46.21 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0099  Ribonucleoside-diphosphate reductase  47.01 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0986719  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24870  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  47.73 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.375933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.96 
 
 
325 aa  117  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2436  Ribonucleoside-diphosphate reductase  47.73 
 
 
326 aa  116  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.788989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10500  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  45.52 
 
 
323 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  45.52 
 
 
324 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10210  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  45.52 
 
 
325 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0322  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.64 
 
 
339 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3288  Ribonucleoside-diphosphate reductase  46.27 
 
 
334 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1751  Ribonucleoside-diphosphate reductase  44.03 
 
 
325 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.179063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  45.52 
 
 
324 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
324 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000335276 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0293  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
329 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.078094  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0317  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
329 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0358  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.7 
 
 
324 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4465  Ribonucleoside-diphosphate reductase  45.3 
 
 
326 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1809  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
320 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1828  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
320 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1875  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.78 
 
 
320 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.114805  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0450  Ribonucleoside-diphosphate reductase  44.03 
 
 
326 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2950  Ribonucleoside-diphosphate reductase  44.03 
 
 
334 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4286  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.03 
 
 
320 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.439345  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7388  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.03 
 
 
329 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3497  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.03 
 
 
324 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3792  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.03 
 
 
324 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13064  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.03 
 
 
324 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0902042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3724  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.28 
 
 
323 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.28 
 
 
328 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3114  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
319 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3134  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.79 
 
 
320 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.664044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1145  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.79 
 
 
320 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2956  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
319 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.01741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2925  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
319 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1464  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.91 
 
 
330 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2991  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
319 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.02246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3008  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
319 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883478 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4378  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.35 
 
 
329 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677637  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2798  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.91 
 
 
319 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.01423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3203  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.91 
 
 
319 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1011  Ribonucleoside-diphosphate reductase  42.42 
 
 
320 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2812  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.91 
 
 
319 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1030  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.91 
 
 
319 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02532  ribonucleotide-diphosphate reductase beta subunit  40.15 
 
 
319 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3920  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.3 
 
 
319 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.54 
 
 
338 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3537  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.55 
 
 
323 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.239174  hitchhiker  0.00144098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.55 
 
 
323 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02496  hypothetical protein  40.15 
 
 
319 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1007  Ribonucleoside-diphosphate reductase  40.15 
 
 
319 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00862585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2957  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.15 
 
 
319 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1062  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.55 
 
 
323 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3156  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.15 
 
 
319 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.245753  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12012  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  37.12 
 
 
322 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0806  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.55 
 
 
323 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28100  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.18 
 
 
341 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl530  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.35 
 
 
340 aa  87.4  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0099  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.35 
 
 
339 aa  87.4  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0176  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  40.91 
 
 
359 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0418  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.86 
 
 
336 aa  84.3  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1705  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  34.62 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000140789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0538  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.3 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0738  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.57 
 
 
338 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00633879  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2945  ribonucleotide reductase  31.71 
 
 
336 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3350  ribonucleotide reductase  31.15 
 
 
336 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.92717  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0475  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.55 
 
 
349 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16400  ribonucleotide reductase, beta subunit  29.91 
 
 
349 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876136  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3158  Ribonucleoside-diphosphate reductase  31.2 
 
 
358 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>