292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1242 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1471  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  99.07 
 
 
322 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
322 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1242  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
322 aa  658    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.469599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1244  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  99.38 
 
 
322 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1444  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
322 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1372  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
322 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  96.89 
 
 
322 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1406  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.45 
 
 
322 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.357607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3937  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.45 
 
 
322 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.216527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1076  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.41 
 
 
322 aa  628  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1511  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  98.45 
 
 
193 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0968  ribonucleoside-diphosphate reductase  56.83 
 
 
429 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3416  hypothetical protein  55.73 
 
 
323 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0962028  normal  0.690578 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3232  hypothetical protein  55.73 
 
 
323 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259813  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0398  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  54.35 
 
 
322 aa  353  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0756  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  54.66 
 
 
323 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0773  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  54.66 
 
 
323 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.443728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2764  Ribonucleoside-diphosphate reductase  55.97 
 
 
331 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  52.34 
 
 
340 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0531925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0542  Ribonucleoside-diphosphate reductase  54.26 
 
 
333 aa  334  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1775  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.9 
 
 
319 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0127237  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0141  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  45.6 
 
 
337 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0380  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.61 
 
 
326 aa  268  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1249  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  45.17 
 
 
320 aa  268  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0256  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  45.77 
 
 
325 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1513  ribonucleoside-diphosphate reductase, subunit beta  98.47 
 
 
133 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1751  Ribonucleoside-diphosphate reductase  43.96 
 
 
325 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.179063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0818  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  44.69 
 
 
319 aa  263  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2436  Ribonucleoside-diphosphate reductase  44.27 
 
 
326 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.788989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3134  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.15 
 
 
320 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.664044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1145  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.15 
 
 
320 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1011  Ribonucleoside-diphosphate reductase  42.72 
 
 
320 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0099  Ribonucleoside-diphosphate reductase  43.38 
 
 
326 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0986719  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3724  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.46 
 
 
323 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10500  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  42.15 
 
 
323 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3114  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.03 
 
 
319 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2956  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.03 
 
 
319 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.01741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0450  Ribonucleoside-diphosphate reductase  42.77 
 
 
326 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2925  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.03 
 
 
319 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.08 
 
 
324 aa  255  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24870  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  45.51 
 
 
322 aa  255  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.375933  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4465  Ribonucleoside-diphosphate reductase  42.86 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2991  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.03 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.02246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3008  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.03 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883478 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7388  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
329 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3288  Ribonucleoside-diphosphate reductase  42.77 
 
 
334 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0322  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.32 
 
 
339 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.46 
 
 
324 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3792  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.46 
 
 
324 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  43.08 
 
 
325 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.77 
 
 
324 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000335276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1464  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.87 
 
 
330 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3497  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.15 
 
 
324 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1809  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.53 
 
 
320 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1828  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.53 
 
 
320 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1875  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.53 
 
 
320 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.114805  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4378  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.74 
 
 
329 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677637  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4286  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  42.21 
 
 
320 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.439345  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12012  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.56 
 
 
322 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10210  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  42.15 
 
 
325 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2798  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.49 
 
 
319 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.01423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0293  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
329 aa  245  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.078094  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0317  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
329 aa  245  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3203  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.18 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2812  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.18 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0358  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.49 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.05 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3537  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.239174  hitchhiker  0.00144098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1030  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.18 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2950  Ribonucleoside-diphosphate reductase  41.23 
 
 
334 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13064  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.85 
 
 
324 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0902042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02532  ribonucleotide-diphosphate reductase beta subunit  40.87 
 
 
319 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02496  hypothetical protein  40.87 
 
 
319 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3920  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.07 
 
 
319 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1007  Ribonucleoside-diphosphate reductase  40.87 
 
 
319 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00862585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1062  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40 
 
 
323 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2957  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.87 
 
 
319 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.31 
 
 
328 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3156  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.25 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.245753  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0806  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.69 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0176  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  37.15 
 
 
359 aa  208  9e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0418  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  38.94 
 
 
336 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl530  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  38.72 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0099  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  37.35 
 
 
339 aa  199  7e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28100  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  36.22 
 
 
341 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1705  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.43 
 
 
320 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000140789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0538  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.6 
 
 
349 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0475  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.28 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02898  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.97 
 
 
347 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1700  Ribonucleoside-diphosphate reductase  27.83 
 
 
346 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3222  ribonucleoside-diphosphate reductase  29.17 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0596  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.05 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.73 
 
 
346 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00345425  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.61 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  27.61 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.94 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.64 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4366  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.7 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  0.0550239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5334  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.52 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>