30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03358 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  100 
 
 
50 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  98 
 
 
50 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  96 
 
 
50 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.596139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  96 
 
 
50 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  90 
 
 
50 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0078  hypothetical protein  52 
 
 
51 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3274  Hok/gef cell toxic protein  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3114  hok/gef family protein  53.33 
 
 
50 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0665  Hok/Gef family protein  46.67 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0483  Hok/Gef family protein  44 
 
 
83 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0600  Hok/Gef family protein  46.67 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00547  toxic polypeptide, small  46.67 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.116391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00536  hypothetical protein  46.67 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0481  Hok/Gef family protein  44 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0479  Hok/Gef family protein  44 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0477  Hok/Gef family protein  44 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3064  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000970176  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3047  Hok/gef cell toxic protein  44 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0629  Hok/Gef family protein  44 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0948  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0947  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4270  small toxic polypeptide  40 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4258  small toxic polypeptide  40 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.504485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0050  small toxic polypeptide  37.78 
 
 
52 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0071  small toxic polypeptide  37.78 
 
 
52 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.722776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3975  Hok/gef cell toxic protein  51.43 
 
 
40 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>