21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3064 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3047  Hok/gef cell toxic protein  100 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0629  Hok/Gef family protein  100 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0479  Hok/Gef family protein  100 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0481  Hok/Gef family protein  100 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0477  Hok/Gef family protein  100 
 
 		 62 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00547  toxic polypeptide, small  100 
 
 		 50 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.116391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00536  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3064  Hok/gef cell toxic protein  100 
 
 		 50 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000970176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0483  Hok/Gef family protein  98 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0665  Hok/Gef family protein  98 
 
 		 50 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0600  Hok/Gef family protein  98 
 
 		 50 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3114  hok/gef family protein  78 
 
 		 50 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  46.67 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  46.67 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  46.67 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  46.67 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  48.89 
 
 		 50 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  46.67 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  46.67 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  46.67 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.596139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>