22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3114 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3114  hok/gef family protein  100 
 
 		 50 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0483  Hok/Gef family protein  80 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0665  Hok/Gef family protein  80 
 
 		 50 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0600  Hok/Gef family protein  80 
 
 		 50 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3047  Hok/gef cell toxic protein  78 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0629  Hok/Gef family protein  78 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0481  Hok/Gef family protein  78 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0479  Hok/Gef family protein  78 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0477  Hok/Gef family protein  78 
 
 		 62 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00547  toxic polypeptide, small  78 
 
 		 50 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.116391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00536  hypothetical protein  78 
 
 		 50 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3064  Hok/gef cell toxic protein  78 
 
 		 50 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000970176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  53.33 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  53.33 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  53.33 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  53.33 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  53.33 
 
 		 50 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  50 
 
 		 50 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  50 
 
 		 50 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  52 
 
 		 50 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  50 
 
 		 50 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.596139 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0078  hypothetical protein  42 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.099278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>