23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0078 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0078  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  54 
 
 
50 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  54 
 
 
50 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.596139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  56 
 
 
50 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  54 
 
 
50 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  52 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  52 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  52 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  52 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  52 
 
 
50 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3274  Hok/gef cell toxic protein  53.66 
 
 
50 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0948  Hok/gef cell toxic protein  40.82 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0947  Hok/gef cell toxic protein  40.82 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0026  protein SrnB  43.9 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3975  Hok/gef cell toxic protein  46.15 
 
 
40 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4270  small toxic polypeptide  31.91 
 
 
52 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0050  small toxic polypeptide  31.91 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0483  Hok/Gef family protein  43.18 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4258  small toxic polypeptide  31.91 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.504485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0479  Hok/Gef family protein  43.18 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0481  Hok/Gef family protein  43.18 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3114  hok/gef family protein  42 
 
 
50 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0477  Hok/Gef family protein  43.18 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>