31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0050 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0050  small toxic polypeptide  100 
 
 		 52 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0071  small toxic polypeptide  98.08 
 
 		 52 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.722776 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4270  small toxic polypeptide  94.23 
 
 		 52 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4258  small toxic polypeptide  92.31 
 
 		 52 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.504485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2239  small toxic polypeptide  56.25 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01376  toxic polypeptide, small  54.17 
 
 		 49 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01388  hypothetical protein  54.17 
 
 		 49 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2080  Hok/gef cell toxic protein  42.22 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01525  hypothetical protein  42.22 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0768658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2073  Hok/gef cell toxic protein  42.22 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01532  small toxic polypeptide  42.22 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3579  Hok/gef cell toxic protein  38.3 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0451527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0018  putative Hok/gef family protein  40.91 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00017  regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC  40.91 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00017  hypothetical protein  38.3 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3975  Hok/gef cell toxic protein  52.63 
 
 		 40 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00018  hypothetical protein  40.91 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3639  Hok/gef cell toxic protein  38.3 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0016  putative Hok/gef family protein  41.86 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  40 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.596139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  40 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0948  Hok/gef cell toxic protein  41.67 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0947  Hok/gef cell toxic protein  41.67 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  40 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  40 
 
 		 50 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  37.78 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  37.78 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  37.78 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  37.78 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  37.78 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0078  hypothetical protein  31.91 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.099278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>