22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00017 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00018  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0018  putative Hok/gef family protein  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00017  regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3579  Hok/gef cell toxic protein  100 
 
 		 50 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0451527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00017  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0016  putative Hok/gef family protein  98 
 
 		 50 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3639  Hok/gef cell toxic protein  98 
 
 		 50 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2073  Hok/gef cell toxic protein  82 
 
 		 51 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01525  hypothetical protein  82 
 
 		 51 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0768658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2080  Hok/gef cell toxic protein  82 
 
 		 51 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000861224  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01532  small toxic polypeptide  82 
 
 		 51 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0050  small toxic polypeptide  40.91 
 
 		 52 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4258  small toxic polypeptide  39.13 
 
 		 52 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.504485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0948  Hok/gef cell toxic protein  43.75 
 
 		 50 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0947  Hok/gef cell toxic protein  43.75 
 
 		 50 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0071  small toxic polypeptide  39.13 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.722776 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4270  small toxic polypeptide  39.13 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3975  Hok/gef cell toxic protein  46.15 
 
 		 40 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  41.86 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  41.86 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  41.86 
 
 		 50 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  41.86 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.596139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>