9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2239 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2239  small toxic polypeptide  100 
 
 		 49 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01376  toxic polypeptide, small  97.96 
 
 		 49 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01388  hypothetical protein  97.96 
 
 		 49 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4258  small toxic polypeptide  54.17 
 
 		 52 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.504485 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4270  small toxic polypeptide  54.17 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0050  small toxic polypeptide  56.25 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0071  small toxic polypeptide  56.25 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.722776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0947  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0948  Hok/gef cell toxic protein  46.67 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>