11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3274 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3274  Hok/gef cell toxic protein  100 
 
 
50 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03407  toxic polypeptide, small  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0155  Hok/gef cell toxic protein  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3758  small toxic polypeptide  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0159  small toxic polypeptide  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03358  hypothetical protein  52 
 
 
50 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4053  small toxic polypeptide  50 
 
 
50 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4933  small toxic polypeptide  50 
 
 
50 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.596139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3878  small toxic polypeptide  50 
 
 
50 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.911707  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3969  small toxic polypeptide  48 
 
 
50 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0078  hypothetical protein  53.66 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.099278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>