26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20490  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 55 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 118 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  80 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  78.18 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  78.18 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  78.18 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  76.36 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  78.18 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  78.18 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  66.67 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  66.67 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  63.64 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  64.81 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  61.82 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  63.41 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  47.46 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  38.89 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>