12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8090 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8090    100 
 
 		 1762 bp  3493    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  82.48 
 
 		 1839 bp  519  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  80.05 
 
 		 1680 bp  168  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  83.98 
 
 		 1740 bp  157  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  84 
 
 		 1791 bp  135  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  79.01 
 
 		 1794 bp  133  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0272    89.29 
 
 		 1374 bp  95.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  82.76 
 
 		 1683 bp  89.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  82.24 
 
 		 1674 bp  87.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  85.86 
 
 		 1716 bp  85.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0265    79.55 
 
 		 450 bp  79.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3729  plasmid partitioning protein  91.89 
 
 		 1698 bp  50.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183946  normal  0.190659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>