15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3251 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3251  chromosome segregation ATPase-like  100 
 
 
1374 aa  2788    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489487  hitchhiker  0.00978978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0798  chromosome segregation ATPase-like protein  48.24 
 
 
87 aa  95.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0392  hypothetical protein  28.21 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1385  hypothetical protein  28.67 
 
 
420 aa  77.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0475901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0849  hypothetical protein  20.46 
 
 
1193 aa  57  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  31.79 
 
 
783 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4470  hypothetical protein  26.33 
 
 
500 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 
1191 aa  47.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  20.26 
 
 
1359 aa  47  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  22.17 
 
 
241 aa  46.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  25.42 
 
 
1037 aa  46.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  23.36 
 
 
441 aa  46.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  26.55 
 
 
1168 aa  46.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  24.48 
 
 
434 aa  46.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.15 
 
 
1177 aa  45.8  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>