173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1189 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1189  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 		 70 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0123555  normal  0.0583593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.33 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  43.75 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  42.19 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  40.58 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  40.58 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  47.17 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  43.4 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  48 
 
 		 55 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13250  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  46.91 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.026804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19510  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  67.44 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000761918  hitchhiker  0.0000000105413 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.27 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705508  normal  0.483483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  46.81 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  42.37 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13380  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  70.73 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.4411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  44.83 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.45 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.71 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  37.88 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  42.5 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  35.09 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.13 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  31.25 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1430  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  62.5 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  47.5 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.04 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  55.26 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.82 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13320  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  62.22 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  41.51 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  41.51 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  37.04 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.79 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  30.36 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.79 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  41.46 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.71 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.29 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  51.22 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  31.75 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  28.57 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.67 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  30.91 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  34.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.38 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  35.85 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  29.31 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  27.59 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  33.85 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.74 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  32.69 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.82 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.14 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>