20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0905 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0905  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301717  normal  0.448068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08050  methyltransferase family protein  46.48 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  hitchhiker  0.0000000452502 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11030  hypothetical protein  33.97 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  26.44 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  24.72 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  26.44 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  26.44 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  21.34 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  24.58 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  25.42 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53251  tRNA methyltransferase, has a role in tRNA modification  25.81 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>