26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2603 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2603  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4336  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  53.12 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7778  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.44 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5072  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  46.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144386  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3825  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.75 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148692  normal  0.0649656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1215  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.88 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2247  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0869  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.86 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0087  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0729  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.62 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0530  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.44 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0032  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.36 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227171  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2743  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.34 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3978  sigma-70, region 4 type 2  37.18 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0029  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.54 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5371  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.08 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0304187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1130  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  28.77 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.938596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198269  hitchhiker  0.000272251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2579  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.81 
 
 		 206 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0588  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.42 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366864  normal  0.0107838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.13 
 
 		 169 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0679  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.92 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.364709  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.13 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1991  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.13 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.91155  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0794  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.1 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.713828  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0810  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.22 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>