20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2632 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  91.3 
 
 
161 aa  307  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  51.85 
 
 
165 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  49.38 
 
 
160 aa  173  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  49.39 
 
 
172 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  43.95 
 
 
161 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  43.67 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  46.38 
 
 
135 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  38.41 
 
 
156 aa  120  9e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  37.42 
 
 
162 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  38.41 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  38.41 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  47.06 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  37.29 
 
 
196 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  40.2 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  26.63 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  33.61 
 
 
216 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  37.93 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  27.12 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  29.51 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>