22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1131 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  43.94 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  48.48 
 
 
156 aa  100  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  45.76 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  45.76 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  41.03 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  39.82 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  40.2 
 
 
161 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  41.18 
 
 
161 aa  84.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  34.62 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  32.82 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  27.63 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  32.38 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  32.69 
 
 
158 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  33.33 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  31 
 
 
161 aa  58.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4743  hypothetical protein  32.81 
 
 
179 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  53.85 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0279  hypothetical protein  29.46 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.971933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0842  hypothetical protein  32.61 
 
 
377 aa  44.3  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>