18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3577 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  34.18 
 
 		 196 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  44.79 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  45.4 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  39.39 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  35.35 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  39.51 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  34.71 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  33.65 
 
 		 216 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  35.67 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  32.47 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  50.49 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  50 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>