19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0374 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  296  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  51.57 
 
 		 156 aa  146  8e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  45.4 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  45.4 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  43.75 
 
 		 199 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  32.65 
 
 		 196 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  49.52 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  37.61 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  37.27 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  49.21 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  37.7 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  35.59 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  33.01 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  30.97 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4174  Domain of unknown function DUF1863  26.19 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>