21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5433 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  42.11 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  35.51 
 
 		 196 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  33.65 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  33.65 
 
 		 162 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  37.61 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  35.48 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  30.41 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  37.27 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  34.45 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  33.94 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  34.43 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  33.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  38.83 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0713  hypothetical protein  30.97 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>