19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0052 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0052  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0374  hypothetical protein  51.57 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3577  hypothetical protein  44.79 
 
 
162 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4230  hypothetical protein  44.79 
 
 
162 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  38.41 
 
 
161 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  46.15 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4258  hypothetical protein  32.65 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4365  hypothetical protein  40.17 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2917  hypothetical protein  41.28 
 
 
199 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  35.98 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1038  hypothetical protein  34.81 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1131  hypothetical protein  48.48 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2059  hypothetical protein  35.54 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0572  hypothetical protein  40.38 
 
 
172 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4437  hypothetical protein  39.32 
 
 
135 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1498  hypothetical protein  39.81 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5433  hypothetical protein  37.27 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  37.7 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  32.88 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>