13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1252 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  31.58 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  26.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  37.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  30.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  23.58 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  32.1 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3360  hypothetical protein  34.94 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2632  hypothetical protein  29.51 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0218176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  23 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1270  hypothetical protein  29.51 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>