15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1065 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  71.71 
 
 		 155 aa  224  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  69.08 
 
 		 155 aa  222  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  68.42 
 
 		 155 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  66.01 
 
 		 164 aa  213  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  57.89 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  45.14 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  29.69 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  31.2 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  25.2 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4174  Domain of unknown function DUF1863  35.53 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2456  nuclease  27.94 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  32.1 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3296  hypothetical protein  29.23 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>