13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2456 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2456  nuclease  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  55 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3118  hypothetical protein  46.81 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  39.85 
 
 		 291 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3296  hypothetical protein  41.98 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0054  nuclease  39.85 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00373612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3751  nuclease  38.35 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4659  hypothetical protein  28 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  30.43 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  27.94 
 
 		 165 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  26.27 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>