12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3297 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2456  nuclease  39.85 
 
 
140 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0054  nuclease  39.23 
 
 
137 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00373612  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  39.39 
 
 
137 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3118  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938253  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3751  nuclease  34.31 
 
 
142 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3296  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  28.35 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  32.95 
 
 
164 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  26.98 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  26.19 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>