14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1266 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  320  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  95.48 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  83.23 
 
 
155 aa  276  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  83.87 
 
 
164 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  69.08 
 
 
157 aa  210  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  54.49 
 
 
156 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  40.82 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  33.59 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  26.98 
 
 
291 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0054  nuclease  31.97 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00373612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0190  hypothetical protein  29.32 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  37.78 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4174  Domain of unknown function DUF1863  31.58 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>