12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  259  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13740  hypothetical protein  69.92 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.325381  normal  0.981447 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4383  hypothetical protein  54.4 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0721  hypothetical protein  53.17 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0027  hypothetical protein  47.2 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2262  hypothetical protein  34.11 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0570  hypothetical protein  28.89 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.642375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  24.8 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  29.32 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  30.08 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  29.63 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>