68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2142 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2142  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  203  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1800  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
104 aa  203  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  36.17 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  29.03 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  34.95 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  35.14 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  35.21 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  36.92 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  38.24 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  29.63 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1561  hypothetical protein  37.88 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  36.56 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  31.58 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  34.38 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  30.26 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  27.85 
 
 
102 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  30.99 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  30.99 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  30.99 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  30.99 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  34.78 
 
 
100 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  33.85 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  25.51 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  32.81 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  27.85 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  30.43 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  29.03 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  31.67 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  29.07 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  27.69 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  31.75 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  30.38 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  37.1 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  33.33 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  29.69 
 
 
105 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  29.55 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  31.58 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  31.58 
 
 
99 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  30.86 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  21.84 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  24.44 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  24.44 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  26.58 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  29.69 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  32.14 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  32.93 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  31.25 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>