15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0024 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0024  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  6e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.43929  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0023  conjugal transfer pilus assembly protein TrbC  38.53 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4297  hypothetical protein  35.19 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.654961 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0032  hypothetical protein  34.45 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451875  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_12  hypothetical protein, putative conjugative transfer protein TrbC  33.88 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4438  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4531  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4623  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4382  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4434  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.341224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4506  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  30.07 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1529  hypothetical protein  30.56 
 
 		 250 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4232  TrbC, sex pilus assembly and mating pair formation protein  30 
 
 		 250 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3771  hypothetical protein  24.64 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5378  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  27.78 
 
 		 247 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.890308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>