12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2330 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  181  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  48.28 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0849  putative ATP synthase protein I  51.72 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  32 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  30.95 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  39.62 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  25.77 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  29.55 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  27.55 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  33.96 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  29.79 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  26.67 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>