29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2226 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  95.68 
 
 
162 aa  316  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  55.28 
 
 
165 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  55.28 
 
 
165 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  55.28 
 
 
165 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  53.42 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  50.68 
 
 
170 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  50.68 
 
 
170 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  50.68 
 
 
170 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  45 
 
 
166 aa  146  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  45.34 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  40.99 
 
 
171 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  50.37 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  38.12 
 
 
164 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  39.46 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  39.51 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  40.99 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  36.02 
 
 
169 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  35.37 
 
 
173 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  40.62 
 
 
163 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  35.44 
 
 
165 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  30.86 
 
 
173 aa  94  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  37.4 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  36.29 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0089  hypothetical protein  27.69 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1509  hypothetical protein  27.69 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1592  hypothetical protein  27.69 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>