More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3838 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  78.87 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2232  IS1 transposase  62 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2198  IS1, transposase orfB  50.88 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0165  insertion sequence protein  44.44 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000498259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2841  IS1 transposase orfB  50.88 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  50.88 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0741  IS1 family transposase orfB  44.44 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  49.15 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  49.15 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1548  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0026  IS1 OrfB  49.12 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000122781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0509  IS1 OrfB  49.12 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0333  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0134876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0917  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0558  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0623  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0560  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0544  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0507  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0444  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000536612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0706  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.60614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0651  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0818  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0802  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0636  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.527887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0461  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0852  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.157864  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0014  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0676781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0457  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689763  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0101  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0130  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000385847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0214  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.672743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0221  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0260  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0270  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0285  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0862  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.537368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0330  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0413  IS1 transposase orfB  49.12 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>