66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1834 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1728  polysaccharide deacetylase  99.67 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2609  hypothetical protein  99.67 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1834  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 301 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2157  polysaccharide deacetylase  73.58 
 
 		 301 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1353  polysaccharide deacetylase  68.92 
 
 		 297 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2925  polysaccharide deacetylase  69.26 
 
 		 297 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2844  polysaccharide deacetylase  65.53 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0804894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2076  polysaccharide deacetylase  62.63 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2692  polysaccharide deacetylase  63.36 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145511  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2528  polysaccharide deacetylase domain protein  61.9 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2485  polysaccharide deacetylase domain protein  62.24 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2410  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  62.24 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1393  polysaccharide deacetylase  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2436  polysaccharide deacetylase  61.9 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2644  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  62.24 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2551  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2401  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02141  hypothetical protein  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1402  polysaccharide deacetylase  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02182  hypothetical protein  61.9 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2632  polysaccharide deacetylase domain protein  61.56 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2540  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  61.9 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  normal  0.731113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3397  polysaccharide deacetylase domain protein  61.9 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4227  polysaccharide deacetylase  60.33 
 
 		 299 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4018  polysaccharide deacetylase  61.49 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1590  hypothetical protein  61.49 
 
 		 295 aa  361  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18340  hypothetical protein  61.49 
 
 		 295 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0923  polysaccharide deacetylase  52.35 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213028 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0277  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3699  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2979  polysaccharide deacetylase  35.74 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2390  putative polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192005  normal  0.179282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1193  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0326614  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0882  polysaccharide deacetylase  36.33 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.698941  hitchhiker  0.000000806635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1318  hypothetical protein  37.33 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1797  polysaccharide deacetylase  36.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3973  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0986666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1254  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 297 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2189  polysaccharide deacetylase family protein  35.23 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1394  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2405  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.498763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5164  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1887  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.65071  hitchhiker  0.000000465895 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0013  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1884  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2279  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1156  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.540807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1410  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.257761 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1863  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6216  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1416  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0922  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.603398 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2241  polysaccharide deacetylase family protein  34.9 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1801  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1773  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3232  polysaccharide deacetylase  35.02 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4593  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000328095  hitchhiker  0.00511566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0430  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2557  polysaccharide deacetylase family protein  31.65 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0436  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  23.11 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>