More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1326 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1326  polysaccharide export protein  100 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.476136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1420  hypothetical protein  98.68 
 
 
303 aa  607  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  82.31 
 
 
285 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2870  hypothetical protein  77.74 
 
 
284 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.3 
 
 
362 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  66.04 
 
 
363 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.06 
 
 
362 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  63.06 
 
 
362 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  66.04 
 
 
362 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  66.04 
 
 
362 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  63.94 
 
 
363 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.93 
 
 
362 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  61.19 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  65.67 
 
 
363 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  64.64 
 
 
362 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  58.76 
 
 
363 aa  355  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  64.18 
 
 
361 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  63.37 
 
 
365 aa  351  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  63.81 
 
 
362 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  58.46 
 
 
374 aa  349  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  61.19 
 
 
363 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  64.39 
 
 
362 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  64.39 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  62.13 
 
 
363 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  60.81 
 
 
365 aa  348  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  61.71 
 
 
365 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  61.19 
 
 
362 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.13 
 
 
362 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  60.07 
 
 
362 aa  346  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.9 
 
 
363 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.4 
 
 
363 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.4 
 
 
363 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.4 
 
 
363 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.4 
 
 
363 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.4 
 
 
363 aa  343  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  60 
 
 
362 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  63.4 
 
 
363 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  62.13 
 
 
363 aa  341  8e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  61.76 
 
 
363 aa  338  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  59.19 
 
 
363 aa  338  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  63.47 
 
 
363 aa  338  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  62.13 
 
 
363 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  60.61 
 
 
362 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  61.19 
 
 
364 aa  334  9e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  58.82 
 
 
363 aa  331  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  59.93 
 
 
363 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  59.47 
 
 
358 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  59.47 
 
 
358 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  62.15 
 
 
373 aa  328  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  61.03 
 
 
363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  56.52 
 
 
364 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  58.36 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  58.87 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  58.02 
 
 
286 aa  318  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  55.43 
 
 
364 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  57.79 
 
 
391 aa  316  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  55.48 
 
 
370 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  55.48 
 
 
370 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  55.48 
 
 
370 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  57.14 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  58.43 
 
 
369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  56.68 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  61.29 
 
 
369 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.6 
 
 
371 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.18 
 
 
371 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.95 
 
 
373 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  56.32 
 
 
369 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  56.57 
 
 
364 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  55.19 
 
 
388 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  56.2 
 
 
364 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  60.7 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  55.84 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  55.84 
 
 
364 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  52.92 
 
 
356 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  55.84 
 
 
364 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.16 
 
 
371 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  52.2 
 
 
428 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.24 
 
 
371 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.24 
 
 
371 aa  305  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  56.57 
 
 
382 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.24 
 
 
371 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.88 
 
 
408 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.89 
 
 
371 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  56.89 
 
 
371 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.89 
 
 
371 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  56.25 
 
 
408 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  55.23 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  56.41 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  55.15 
 
 
364 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  56.32 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  56.32 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  56.32 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  56.32 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>