More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2870 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2870  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  84.59 
 
 
285 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1326  polysaccharide export protein  77.74 
 
 
303 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.476136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1420  hypothetical protein  77.39 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  68.99 
 
 
363 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  68.63 
 
 
363 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.02 
 
 
362 aa  361  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  67.59 
 
 
361 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.02 
 
 
362 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  63.02 
 
 
362 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  62.26 
 
 
363 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.91 
 
 
362 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.15 
 
 
362 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  61.11 
 
 
365 aa  350  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  63.95 
 
 
362 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  63.02 
 
 
362 aa  349  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  61.65 
 
 
363 aa  349  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  63.91 
 
 
363 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  62.26 
 
 
363 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.53 
 
 
363 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.53 
 
 
363 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.53 
 
 
363 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
363 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.16 
 
 
363 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 
363 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  63.02 
 
 
362 aa  345  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  61.76 
 
 
365 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  59.4 
 
 
363 aa  344  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  63.64 
 
 
365 aa  344  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  59.02 
 
 
374 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  62.64 
 
 
362 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  63.95 
 
 
362 aa  340  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  63.95 
 
 
362 aa  340  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  62.64 
 
 
363 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  60.94 
 
 
362 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  62.26 
 
 
362 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  59.62 
 
 
363 aa  338  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  62.26 
 
 
363 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  64.98 
 
 
363 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  61.13 
 
 
363 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  60.75 
 
 
363 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  60.94 
 
 
362 aa  333  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  61.76 
 
 
363 aa  331  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  59.07 
 
 
362 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  61.98 
 
 
362 aa  328  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  59.33 
 
 
363 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  59.09 
 
 
358 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  59.09 
 
 
358 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  56.12 
 
 
364 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  60.23 
 
 
364 aa  323  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  57.2 
 
 
388 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  59.33 
 
 
306 aa  322  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  58.49 
 
 
364 aa  321  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  60.53 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  61.07 
 
 
363 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  59.77 
 
 
364 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.4 
 
 
364 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  59.4 
 
 
364 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  61.83 
 
 
369 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  58.96 
 
 
373 aa  315  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  62.24 
 
 
369 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  61.83 
 
 
369 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  58.87 
 
 
370 aa  314  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  58.87 
 
 
370 aa  314  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  57.51 
 
 
364 aa  314  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  58.87 
 
 
370 aa  314  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  58.46 
 
 
364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  62.2 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  59.53 
 
 
364 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  53.6 
 
 
379 aa  311  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  56.23 
 
 
371 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  59.43 
 
 
355 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  59.52 
 
 
376 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  60.66 
 
 
369 aa  308  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  60.25 
 
 
369 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  61.48 
 
 
370 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.36 
 
 
371 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0312  iron-sulfur cluster assembly/repair protein  59.33 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  57.47 
 
 
382 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  55.73 
 
 
382 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  56.36 
 
 
371 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.36 
 
 
371 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.36 
 
 
371 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.36 
 
 
371 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  61.11 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  56.73 
 
 
373 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>