146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1024 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1024  colicin V production protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0900  colicin V production protein  97.24 
 
 		 217 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  59.6 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  32.45 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  31.79 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  33.11 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0811  Colicin V production protein  48.19 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.270792  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  26.55 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  27.15 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  27.15 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  32.45 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  29.63 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  31.01 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.01 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  27.81 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  29.05 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  31.39 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  29.61 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  28.48 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  26.54 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  31.62 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  32.45 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  30.26 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  30.26 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  34.21 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  30.82 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  31.79 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  28.65 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  28.93 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  25.32 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  30.15 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  30.15 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  28.36 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  26.11 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  30.15 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  30.15 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.03 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  26.97 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  27.37 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  30.15 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  28.4 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  26.29 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  26.01 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  29.75 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  26.63 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  27.81 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  26.51 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  30.15 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  30.77 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  29.14 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  28.48 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  27.17 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  29.07 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  27.81 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  27.81 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  27.81 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  27.73 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  26.04 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  27.45 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  31.37 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  29.11 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  28.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  28.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  27.85 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  26.79 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  33.77 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.75 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  26.06 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  26.67 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  27.27 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  27.27 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  26.95 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.62 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  27.59 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  27.22 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  27.22 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  26.58 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  27.85 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  29.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  27.22 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  29.08 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>