15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1581 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0915867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1638  phage-related integrase  96.33 
 
 		 129 aa  214  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  88.06 
 
 		 179 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1144  hypothetical protein  62.86 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  38.46 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  33.33 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  43.14 
 
 		 377 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  38.18 
 
 		 414 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  37.74 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  38.1 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  39.58 
 
 		 324 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  37.04 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  45.65 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  36.84 
 
 		 299 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  36.84 
 
 		 416 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>