78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1056 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 106 aa  219  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.79 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  73.24 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  70.67 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  65.38 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.92 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.55 
 
 		 109 aa  116  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.8 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.83 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.2 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.14 
 
 		 99 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  59.6 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.92 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.06 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.86 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.86 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.86 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.57 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.54 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.44 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.44 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.67 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.33 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.01 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.74 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.68 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  59.46 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  63.01 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.27 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  58.67 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.33 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.35 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.48 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.72 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1251  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.54 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.38 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.38 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.44 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.58 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.12 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0270221  normal  0.0778742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.35 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.460728  normal  0.0643134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  38.81 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.61 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.56 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.15 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.77 
 
 		 106 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2693  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1600  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3094  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2607  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.4 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0698  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.16 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.730244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0785  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.16 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.85 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.38 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.27 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0521  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.03 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 80 aa  40  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00150413  normal  0.403792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0679  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.03 
 
 		 102 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.974986  normal  0.0638753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>