18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4970 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  70.39 
 
 
322 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  66.67 
 
 
319 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  65.89 
 
 
402 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  66.67 
 
 
311 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  61.22 
 
 
320 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  63.58 
 
 
308 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  61.56 
 
 
343 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  58.48 
 
 
327 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  61.9 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  48.68 
 
 
296 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  39.94 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.34 
 
 
828 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  23.03 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  23.51 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  23.2 
 
 
517 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  22.98 
 
 
918 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3161  zinc finger CHC2-family protein  25.2 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>